USBタイプのA/D変換機のデータについて

以下の環境でのプログラム開発を実施中です。

1)App Designerプログラム開発用：PROBOOK450(G8、メモリ32GB、MatlabR2020b）

2)アプリ動作確認用：Surface Go3（メモリ8GB、Matlab Runtime2020b）

使用するA/Dは以下です。

a)東陽テクニカ製：485B36（A/D変換機、2ch）

このA/D変換機を1)上で動作させると1ch、2chともに同じ信号がA/Dとして出力されます。

一方、EXE化したアプリを2)上で動作させると、1ch、2ch別々の信号がA/Dとして出力されます。

使用している関数はaudiorecorderおよびgetaudiodataです。

USB端子もしくはPC端末に応じて上記A/Dの出力が変わることはありうるのでしょうか？