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1. Yes, among a few of my personal preferences I change the background color of all my figures to white by default. Here's what I have in my startup.m file:
set(0,'DefaultFigureColor','White',...
'DefaultTextFontSize',14,...
'defaultaxesfontsize',14,...
'DefaultAxesFontname','Times',...
'DefaultTextFontName','Times')2. If you want some padding, use the -nocrop option when you use export_fig.
3. I suspect that adding edgealpha is changing your figure renderer to OpenGL, because OpenGL is the only renderer that can handle transparency. Instead of making the lines transparent, you can turn them off entirely, or make them very thin. Above, you specified a linewidth of 2. Let's make it quite a bite smaller:
h = surf(peaks);
axis tight
camlight
colormap(winter(256))
lighting phong
shading interp
set(h,'edgecolor',[0 0 0.4],'meshstyle','both',...
'linewidth',.0001);
export_fig test -png -nocrop -m7 -q101
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