John Williams

State University of New York Stony Brook

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Multiband Artifact Regression in Simultaneous Slices (MARSS)
Detection and removal of an artifactual shared signal between simultaneously acquired slices in unprocessed multiband fMRI.

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Sensory-Thalamic-Localizer
Sensory Thalamic Localizer

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Multiband Censoring Optimization Tool (MCOT)
Multiband Censoring Optimization Tool (MCOT) for Resting-State Functional Connectivity Analyses

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Palm-From-Excel
Wrapper for FSL PALM to use an Excel file to determine input options.

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Toolkit_for_MIRA_LAB_Striatal_Segmentation
This is a pipeline that produces CNN-based segmentations of the striatal regions of the brain based on a structural T1w image.

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BCa_bootstrap
Computes the bias-corrected and accelerated bootstrap estimate with confidence intervals and 2-tailed p-values

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Bootstrapping and p-values (t-test when using bootci)
While this post is 2 years old, just in case it helps someone - here is some code that can compute bootstrap CIs and P values ba...

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bootstrap p-value
Here is some code my advisor wrote back in 2009 that can get the actual P value (rather than simple determine if it is great...

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