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dendrogram​関数の結果から、閾値​以下のグループ数をカ​ウントする方法につい​て

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denpika
denpika am 17 Jul. 2018
Kommentiert: denpika am 18 Jul. 2018
以下のコードを実行すると閾値0.4以下のノードが4色に塗り分けられますが、塗り分けられた色の数(グループの数)をカウントする方法はないでしょうか?
rng('default')
X = rand(20,2);
tree = linkage(X,'average');
dendrogram(tree,0,'ColorThreshold',0.4);

Akzeptierte Antwort

michio
michio am 17 Jul. 2018
かなり不格好ですが・・ラインハンドル H から全ての色を確認し、何種類の色が存在するかをチェックすることでグループ数を確認できます。
rng('default')
X = rand(20,2);
tree = linkage(X,'average');
dendrogram(tree,0,'ColorThreshold',0.4);
[H,T,outperm] = dendrogram(tree,0,'ColorThreshold',0.4);
lineColors = vertcat(H.Color); % Lineオブジェクトの色を行列に結合
uniqueColors = unique(lineColors, 'rows'); % ユニークな色(黒も合わせて出てきます)
size(uniqueColors,1) - 1 % 黒以外の色の数
  3 Kommentare
michio
michio am 17 Jul. 2018
上で得られたグループ数を使って
[H,T,outperm] = dendrogram(tree,4);
と実行すれば、少なくとも各グループの番号は取得できますがいかがでしょうか。
find(T==1)
denpika
denpika am 18 Jul. 2018
解決しました、ありがとうございました。

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