Estimate kinetic parameters for optimization

Hello,

I am new to Matlab and I have a series of data. I want to estimate kinetic parameters for optimization. I made the code by referring to the relevant code (Thanks for star strider).

But, I would like you to look at my code for review, and le me know if there is a better way.

Because I want to get the better result.

I need your help.

(I used R2023a version)

I would really appreciate the help. Thanks in advance.

.

Answer 1

[CD]

ode15s 함수를 통해 미분 방정식을 풀이하고

lsqcurvefit 함수를 통해 최적화하는 과정이 적절해 보입니다.

좀 더 좋은 fitting 결과를 얻고 싶다면,

ode15s 및 lsqcurvefit의 fitting 옵션을 조정해 볼 수 있습니다.

ode15s의 경우, 'RelTol' 및 'AbsTol'을

lsqcurvefit의 경우, 'Algorithm', 'FiniteDifferenceType', 'MaxFunctionEvaluations', 'MaxIteration', 'FunctionTolerance', 'StepTolerance' 등을 조정해 보는 것을 권장합니다.

각 옵션에 대한 설명은 아래 링크로 대신합니다.

https://kr.mathworks.com/help/matlab/math/summary-of-ode-options.html

https://kr.mathworks.com/help/optim/ug/optim.problemdef.optimizationproblem.optimoptions.html

추가1) 각 iteration 별 정보는 'Display' 옵션을 'iter-detailed'로 설정하여 확인할 수 있습니다.

추가2) 유사한 피팅 과정에서 'FiniteDifferenceType'을 'forward'로, 'ScaleProblem'을 'jacobian'으로 설정하였을 때 큰 효과를 본 경험이 있습니다.