MIN1PIPE
Version 1.0.2 (25,3 MB) von
Jinghao Lu
A MINiscope 1-photon-based Calcium Imaging Signal Extraction PIPEline.
A MINiscope 1-photon-based Calcium Imaging Signal Extraction PIPEline.
MIN1PIPE is a fully automatic, Matlab-based toolbox, solving the full range problems in 1-photon calcium imaging in one package: data enhancement → movement morrection → signal extraction. It requires minimal parameter-tuning and integrates the semi-auto options. Each inidividual module can also be easily adapted for the 2-photon imaging setting.
Zitieren als
Jinghao Lu (2024). MIN1PIPE (https://github.com/JinghaoLu/MIN1PIPE), GitHub. Abgerufen .
Lu, Jinghao, et al. “MIN1PIPE: A Miniscope 1-Photon-Based Calcium Imaging Signal Extraction Pipeline.” Cell Reports, vol. 23, no. 12, Elsevier BV, June 2018, pp. 3673–84, doi:10.1016/j.celrep.2018.05.062.
Kompatibilität der MATLAB-Version
Erstellt mit
R2018a
Kompatibel mit R2018a bis R2019a
Plattform-Kompatibilität
Windows macOS LinuxKategorien
Mehr zu Microscopy finden Sie in Help Center und MATLAB Answers
Tags
Community Treasure Hunt
Find the treasures in MATLAB Central and discover how the community can help you!
Start Hunting!Live Editor erkunden
Erstellen Sie Skripte mit Code, Ausgabe und formatiertem Text in einem einzigen ausführbaren Dokument.
utilities/CNMF
utilities/RNN
utilities/elements
utilities/movement_correction
utilities/postprocess
Versionen, die den GitHub-Standardzweig verwenden, können nicht heruntergeladen werden
Version | Veröffentlicht | Versionshinweise | |
---|---|---|---|
1.0.2 | up-to-date git version |
|
|
1.0.1 | Full version |
|
|
1.0.0 |
|
Um Probleme in diesem GitHub Add-On anzuzeigen oder zu melden, besuchen Sie das GitHub Repository.
Um Probleme in diesem GitHub Add-On anzuzeigen oder zu melden, besuchen Sie das GitHub Repository.