How do i find the standard deviation of every row of a 12*18 cell array?

How do I find the standard deviation of every column across each row of a 12*18 cell array?

Every cell contains a 69*69 double, and I want the output to be a 12*1 cell array, with each cell being a 69*69 double.

Find the attached 12*18 cell array.

c = load('mean.mat')

c = struct with fields:
    z: {12×18 cell}

c.z{2,18}

ans = 69×69

NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 29.2297 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 0.8942 0.6667 0 NaN NaN NaN

[Torsten]

I tested the content of 3 cells, and I only found NaN values.

So the result is simple: standard devaiation = NaN for all cells.

[Anshu Gajraj]

@Torsten it is not only NaN values. If you scroll to the right and below, you will see numerical values.

[Torsten]

And how to handle NaN values in computations ? Just ignore them ?

[Image Analyst]

So for each of the 12 rows, you have 18 69x69 arrays. How exactly do you want to turn those 18 matrices into a single 69x69 matrix?

[Torsten]

I think computing the standard deviation over the 18 values for each position of the 18 matrices of size 69x69.

[Anshu Gajraj]

@Image Analyst I want to turn those 18 matrices into a single 69x69 matrix by finding their std.

Like this: Cell 1x1 of the 69x69 output matrix will be = std of cell 1x1 of each of the 18 matrices

Cell 1x2 will be std of cell 1x2 of each of the 18 matrices and so on (it will be std of those 18 values).

[Anshu Gajraj]

@Torsten no, dont ignore the NaN values. Just use them normally in std command.

[Image Analyst]

"Cell 1x1 of the 69x69 output matrix will be..." <=== No. You said the output matrix is 12 by 1, not 69 by 69.

Is the stddev of the 69x69 matrix the stdev of all the non-nan values in the whole array, or do you want a 69x1 array which has the stdevs of each row in the 69x69 array?

Answer 1

[Sulaymon Eshkabilov]

Her is one solution:

C = load('mean.mat').z;
S =C; 
for ii = 1:12
    for jj=1:18
            IDX  = isnan(C{ii,jj});
           S{ii,jj}(IDX)=0;
    end
end
%%
ZS1 = cellfun(@std, S, 'UniformOutput', false);
ZS2 = cellfun(@std, ZS1, 'UniformOutput', false);
ZS2 = ZS2.';
ZSS = num2cell((std(cell2mat(ZS2)).'));   % ANSWER